《婚姻法》規定了夫妻雙方可以對其財產進行約定，而婚前財產公證則是夫妻雙方處理婚前財產的一種方式。婚前財產公證對夫妻雙方均有約束力，一旦發生糾紛，即可按照公證內容，明晰分配，避免一些因財產分配問題引起的其他不必要爭端。但事實上，婚前財產公證也可能造成一定程度的不公平。
1、有人為躲債而申請財產公證
婚前財產公證以婚姻成立為前提，如果婚姻不成立，公證也是無效的。現實中還存在這樣一類現象，例如某男在婚前有自己的財產，并且還有一些債務，為了躲避債務，他便將婚前財產公證為未婚妻所有，在雙方結婚后，該男子被追債或被法院強制執行時，因為自己原有的財產已經屬于妻子，便不能被強制執行，這無疑損害了債權人的利益。
2、可能造成一定程度的不公平
婚前財產公證因無年限限制，因此在平衡雙方利益時可能會造成一定程度的不公平。如夫妻雙方在結婚前，將房屋等財產公證為男方所有，而十幾年后，雙方有了子女，但尚未成年，在這時發生婚變，男方拋棄了女方和孩子，而女方在婚前公證時一無所有，那么她和孩子的處境將會十分艱難。
3、無法保護無形財產
婚前財產公證可以較容易地界定婚前的財產，也可以界定婚后雙方共同創造的財產，這些都是有形的產權。但是在知識經濟時代，無形財產已經越來越重要。婚姻財產的分配僅限于有形財產是不夠的，如夫或妻一方的知識積累，雙方努力創造的產品、品牌等無形財產，凝聚著雙方的努力和幫助，如何保護這部分財產，目前的婚前財產公證還無法在技術上做到合情合理。
