購房者在簽補充協議時應注意以下幾方面：
一、公平原則
補充協議條款的制定并不是房地產商的單方行為，購房者作為合同的另一方，同樣具有平等主張、保護自身利益的合法權利。任何發展商以單方名義制訂并要求購房者無條件簽署的補充協議都有可能是違背購房者意愿的，在法律上是無效的。因此，開發商在要求購房者簽訂補充協議時，應對其內容予以明釋。例如，在銷售精裝修房屋時，有的開發商對于合同約定的裝修材料裝修標準的改變，只是明確了告知購房者的義務，而對于改變后的質量、價格、檔次、環保均不予明確，根本沒有給予購房者選擇或是確認的權利，這在實際上已經嚴重損害了購房者的合法利益。一旦出現問題，極易使買賣雙方產生糾紛。
二、合法原則
雙方簽訂的補充協議作為合同不可分割的組成部分，只有約定的內容合法，才能得到法律的保護。
在實際交易中，開發商在起草補充協議時，有時為了迎合或是滿足個別購房者的利益要求，將一些公用面積和使用空間擅自“許配”，從而損害了其他購房者的利益。例如，一家開發商在銷售寫字樓時，購房單位提出了一個條件，即將寫字樓的外墻使用權歸該購房單位無償使用。開發商明明知道外墻使用權歸所有購買寫字樓的業主，開發商個人沒有任何承諾的權利，但是，為了促進銷售，在沒有得到其他業主同意的情況下，開發商便同意了這家購房單位的要求，并將此條款寫入補充協議。事后可想而知，由于合同約定的該內容損害了其他人的合法利益而導致此項內容無效。
三、注意事項
1、廣告和售樓書中的有關內容。消費者入住時發現房子有些地方與當初廣告和樓收中承諾的并不一樣，這種情況在生活中并不鮮見。把廣告和樓書中的相關內容加入合同，產生糾紛時可以作為消費者投訴的有利證據。2003年6月生效的《最高人民法院關于審理商品房買賣合同糾紛案件使用法律若干問題的解釋》中為了保護購房人利益，規定將開發商就商品房規劃范圍內的房屋及相關設施所做的具體明確的、并且對買賣合同的訂立及房屋價格有重大影響的說明和允諾視為合同內容。開發商如果違反這樣的內容，應當承擔違約責任。
2、補充協議中一定要注明因開發商違約造成退房的違約責任。由于開發商原因導致消費者退房的事很多。但也僅限退房，對開發商如何“補償”要求的不多。開發商違約致使退房，負些賠償也是應該的，因為這種“賠償”和消費者交定金但“不買不退”的道理一樣。許多合同中都約定因“不可抗力”導致誤工等，開發商可以不負違約責任，但卻不可作為開發商推脫責任的借口。
3、對物業服務所達到的標準也應注明。物業服務是辦完入住手續后才發生的事實，與業主當初想象的可能存在著這樣或那樣的差異，容易產生糾紛。在合同中注明要求及責任，對雙方都有利
如何通過一份公平合理的補充協議充分維護買賣雙方的合法權益，在房地產交易中具有舉足輕重的意義。因此，為避免制定無效條款，雙方在簽署補充協議時，應根據《合同法》中關于有效合同的規定，來擬定合法的合同條款。另外，雙方在簽訂購房合同和補充協議后，在合同履行期間，如果雙方出現新的協議內容或需要對原來簽訂的內容協議變更，均可通過補充協議的形式予以約定。
